Naruto, Sasuke ile şelaledeki dövüşünün ardından Sasuke'yi geri
getirmekte başarısız olmuştur. Orochimaru'nun Sasuke'nin vucudunu
tamamen ele geçirmesi 3 yıl sürecektir. Bu süre içinde Naruto'nun,
Sasuke'yi geri getirmesi gereklidir. Ancak bu kez Sakura da, Naruto'ya
yardım etmeye karar verir. Bu yüzden, Naruto; Jiraiya'nın, Sakura;
Tsunade'nin öğrencileri olur ve eğitimlerine başlarlar. Tüm bunlar
olurken Akatsuki'nin başka planları vardır.
Naruto Shippuuden, uzun zamandır doldurma bölümlerle ilerleyen TV
serisinin mangayı bıraktığı yerden (135. Bölüm) sonrasını anlatıyor.
Aranızda Narutoyu izleyenler varsa zaten Sasuke kaçırıldıktan sonraki
bölümlerin sallama oldugunu fark etmiştir. Bu bağlamda o bölümden sonra
Naruto’nun artık sıkıcı gelmeye başladığını düşünen çok kişi var.Belki
Naruto Shippuuden’in de iyi olmadığını düşenenler vardır. Ama tamamen
yanıldıklarını göreceksiniz.
Naruto’da heyecanını kaybetmiş hikaye Naruto Shippuuden de tekrar can
buluyor.Özellikle kahramanlarımız artık çocuklukluk dönemini bitirip
birer "Delikanlı" 
olarak çıkıyorlar karşımıza.Sakura’nın o mızmız halinden sıkılanlar
Sakura’yı bu dizide yepyeni haliyle göreceksiniz. Tabi Naruto’nun da
ilerleyişi oldukça fazla.Yani bu yeni dizide yeni teknikler, yeni
süprizler ve yeni maceralar bizleri bekliyor …
